旨在植入活體（如動物或人類）內的RFID裝置具有特殊要求。它們需要被包裹在一種特殊的外殼中，這種外殼不會刺激或與插入的活組織發生反應。外殼還必須對激活芯片的掃描射頻光束透明。一些RFID供應商已經創造瞭用於這些應用的生物相容性玻璃。

放置在生物體內的一個潛在問題是微小的RFID設備可能在皮膚下移動。這可以通過使用特殊材料來避免，這些材料實際上讓周圍組織長到套管並與之結合。

因為激活包含識別號的微芯片的射頻波僅在幾英尺（或更小）內有用，所以RFID芯片通常非常靠近皮膚表面插入。

設備的放置通常使用皮下註射針進行。這種插入方法也決定瞭裝置的形狀和尺寸;可植入的RFID設備通常是一粒米的大小和直徑。對於狗，該裝置通常植入肩胛骨之間。

ID腕帶內置芯片已放置在奶牛內;關於讓所有母牛都植入RFID設備的討論是由於最近對瘋牛病的恐慌造成的。狗主人使用ID腕帶內置芯片識別他們的寵物而不是紋身（更傳統的方法）。